Ugroženost i zaštita
Prema IUCN-u dunavski vodenjak globalno spada u Gotovo ugoženu vrstu (NT: Near Threatened) i to vrlo blizu Osjetljive (VU: Vulnerable). Zaštićen je Bernskom konvencijom (Appendix II, strogo zaštićena vrsta) i Europskom (Habitat) direktivom o zaštiti staništa i vrsta. U Hrvatskoj i Srbiji je označena također kao NT, dok je se u Bosni i Hercegovini smatra kao takson bez dovoljnog broja podataka (DD: Data Deficient) uz pretpostavku da se radi o ugroženoj vrsti (EN - Endangered). Procjena stepena ugroženosti prema DELH-u (Distribution, Ecology, Life History Data) na nivou Bosni i Hercevoine također sugerišu da se radi o ugroženoj vrsti (EN), te da se radi o visoko-prioritetnoj vrsti vodozemca za zaštitu u Bosni i Hercegovini. Nema CITES status.
Područja u kojima obitava dunvski vodenjak (nizijska područja) su pod najvećim antropogenim uticajima u Evropi. S obzirom da dunavski vodenjak naseljava područja koja su uglavnom od poljoprivrednog i ribolovnog značaja za čovjeka, pogodna staništa za ovu vrstu brzo se mijenjaju ili nestaju. Glavni faktori ugroženosti i izumiranja ove vrste su gubitak ili destrukcija staništa kroz: (1) širenje obradivih površina i isušivanje vodenih tijela (jer tjera vodenjake da koriste privremene lokve koje brzo isušuju), (2) korištenje hemikalija (poput pesticida koje uzrokuju veliku smrtnost) i (3) poribljavanje stajaćica u kojima se razmnožavaju vodenjaci (jer ribe se hrane njihovim jajima i ličinkama).
U Europskoj uniji nezakonito je loviti i posjedovati dunavske vodenjake. Isto tako, zabranjeno je njihovo ubijanje ili nanošenje štete njima ili području u kojem žive. Nažalost, dunavski vodenjak u Bosni i Hecegovini nije zaštićen zakonom, a u Bosanskoj Posavini trenutno ne postoje zaštićena područja. Rezervat prirode Gromiželj (8 km2) je izgubio status zaštite ove godine (2016), gdje se trenutno nekontrolisano se vrši sječa šume crne johe (Alnus glutinosa), zagađenje zemljišta i vode različitim otpadnim materijalima, te eksploatacija životinjskih resursa kroz lov i ribolov. Isto tako, Ramsarsko područje Bardača (kompleks jezera smještenih između rijeka Save i Vrbas) gotovo da ne postojii, jer je već 9 (od 11) jezera presušeno i pretvoreno u privatno poljoprivredno zemljište.